李汝琦主要作品
《中国科学通报》动物生态学家当前的任务，1956，(1): 7，(与林长山合作)
百家争鸣来自遗传学，光明日报，4月29日，1957。
北京林蛙个体发育的研究ⅰ.鳃和肺的发生、发育和变化，1958，10 (1): 35-52，动物学报，(与蒋先群合编)
无尾两栖类蝌蚪品尝器的研究，北京大学学报，1958，(2): 235-249(与蒋先群合作)。
北方狭口蛙个体发育的研究ⅱ。食物对消化系统发育的影响。北京大学学报，1959，(1): 75-98。(与林志春合作)细胞遗传学发展中的几个问题。生物通报，1962，(2): 32-38。
细胞遗传学的现状与展望。细胞学进展，1962，261-274。
北方狭口蛙个体发育的研究ⅲ。几种重要血管的发生和变化。动物学报，1964，16 (4): 520-531，(与吴·)
生物科学趋势，1964，2: 2-170细胞遗传学基本原理，1981。
中国大百科全书生物遗传学卷，北京:中国大百科全书出版社，1983，128-131。(总编辑李如琪，副总编辑谭等。)
摇蚊唾液腺多线染色体的研究ⅰ.染色体ⅳ的组织化学分析。遗传学报，1985，12 (1): 61-66，(与吴·)
摇蚊唾液腺多线染色体的研究ⅱ。从幼虫到成虫染色体I和II的可逆变化。遗传学报，1985(与吴合作)
遗传遗传学，北京:科学出版社，1985。
实验生物学论文选。北京:科学出版社，1985。
生物学纲要，北京大学出版社，2006年9月4日，李菊池，果蝇染色体畸变对发育的影响。遗传学，1927，12: 1-58。
李菊芝，卡尔文·布里奇斯。果蝇缺口的缺陷区域。华盛顿卡内基研究所第399号出版物，1929，p.91-99。李菊池，博士，紫丽蚌的精子发生和染色体。北京博物通报，1930-1931，5(2): 1。
贾-谭晨，李菊芝博士，瓢虫的颜色模式变化。) .北京自然历史公报，1932-1933，7:175。
嘉谭晨，李菊池。雌雀鞘翅颜色模式的遗传。美国博物学家，1934，68。
李菊池，徐玉林。高温下果蝇退化翅的发育。遗传学，1936，21:248-259。
李菊池。中国马的六染色体。理科1937，86 (2):222。某些x染色体缺陷对果蝇胚胎发育的影响。日记帐支出。2001.83 (2):271.